ikiwiki understøtter placering af sider i et mappehierarki. Eksempelvis har denne side, UnderSide, nogle relaterede sider placeret under sig, bl.a. HenvisningsRegler. dette er en praktisk måde at bringe orden i din wiki fremfor blot at have een stor mappe fuld af sider.

En UnderSide oprettes ved blot at oprette undermappen og tilføje sider til den. Denne side er eksempelvis subpage.mdwn i kildekoden til denne wiki, og der er også en subpage-undermappe, som indeholder subpage/linkingrules.mdwn. Undersider kan nedarves lisså dybt du har lyst.

Henvisninger til og fra en ?UnderSide er forklaret under ?HenvisningsRegler.